ישיבת באר יהודה היא ישיבה חרדית ספרדית העומדת בראשותו של הרב אליהו טופיק וממוקמת בשכונת סנהדריה בירושלים. מוסדות הישיבה כוללים ישיבה קטנה, ישיבה גדולה, כולל אברכים בשם 'באר מים חיים' המיועד עבור בוגרי הישיבה ומכון להוצאת ספרים בשם 'תורת אמת'.